20世纪末，科学技术日新月异，知识经济初现端倪，人类社会正进入知识经济时代，创新能力成为国家竞争力的核心。1998年，党中央、国务院批准中国科学院实施知识创新工程，作为建设国家创新体系的试点。从此，中国科学院进入了一个新的发展时期。2002年，中国科学院提出了新时期办院方针，并在此基础上提出了新时期发展战略，明确了21世纪前20年的奋斗目标。